A Sociedade Portuguesa de Medicina Desportiva (SPMD) foi constituída por escritura pública a 15 de Outubro de 1994, em Lisboa, por 17 médicos fundadores.
Este acto público decorreu como consequência do condicionalismo existente até então, dado que a S.P.M.D. era uma secção da Sociedade de Ciências Médicas de Lisboa.
Elaboraram-se e aprovaram-se os Estatutos e o Regulamento Interno. De modo a que a S.P.M.D. pudesse desempenhar uma função mais interventiva, aglutinadora dos seus membros e mais dinâmica, criou-se uma sede na Av. Almirante Gago Coutinho, nº 151, em Lisboa.
Aprovou-se o símbolo da SPMD, organizou-se um secretariado próprio que permitisse uma estrutura indispensável ao seu funcionamento e iniciaram-se várias realizações.
Em Maio de 2016, foi adquirido um imóvel onde funciona, actualmente, a sede administrativa, sito na Av. Estados Unidos da América 137, cave esq em Lisboa.
A Sociedade Portuguesa de Medicina Desportiva é membro da Federação Internacional de Medicina Desportiva (FIMS) e da Federação Europeia de Associações de Medicina Desportiva (EFSMA).